Hoewel de Thule ClipOn 9103 veel pluspunten kent, zijn er ook enkele nadelen die het overwegen waard zijn. Het belangrijkste aandachtspunt is dat de drager niet universeel is. Er zijn namelijk twee versies (9103 en 9104) beschikbaar, elk met een andere buisdiameter en compatibiliteit voor specifieke automodellen. Dit betekent dat je goed moet controleren of de juiste versie past bij jouw auto. Dit enige gebrek aan flexibiliteit kan voor sommige consumenten beperkend zijn, vooral als je meerdere auto’s hebt of van plan bent de drager op verschillende modellen te gebruiken.
Daarbij komt dat het systeem enkel geschikt is voor stationcars en hatchbacks. Voor andere voertuigtypen, zoals sedans, SUV's of bestelwagens, is deze drager minder geschikt of zelfs niet te monteren. Dat kan een beperking zijn voor mensen met verschillende soorten voertuigen in gebruik.
De ClipOn 9103 werkt prima met standaardfietsen, maar voor fietsen met afwijkende frames heb je de extra adapter nodig (Thule Bike Frame Adapter 982), wat een extra aankoop en investering betekent. Dit kan als minder praktisch worden ervaren, zeker als je wisselt tussen verschillende soorten fietsen.
Ten slotte kan de drager, hoewel opvouwbaar, toch nog een redelijk omvangrijke vorm hebben als hij is ingeklapt, wat voor sommige gebruikers minder handig is bij beperkte opslagruimte. Ook al is het montageproces eenvoudig, het ophangen aan de achterklep vereist wel enige voorzichtigheid en ervaring om te voorkomen dat de auto beschadigd raakt als het niet correct wordt gemonteerd.
