Ondanks de sterke punten kent de Yakima FullBack 2 ook beperkingen. De meest pregnante beperking is dat de drager alleen geschikt is voor auto's die in de FIT LIJST staan; staat jouw auto er niet bij, dan is de drager simpelweg niet bruikbaar. Dit beperkt de flexibiliteit voor gebruikers met minder gangbare of nieuwere voertuigen. Daarnaast is de capaciteit van twee fietsen fijn voor de meeste recreatieve doeleinden, maar onvoldoende als je regelmatig met meer fietsen of grotere groepen reist.
Een ander nadeel is dat de TubeTop™-adapter, die voor veel moderne frametypes noodzakelijk kan zijn, apart wordt verkocht. Dat betekent extra kosten en planning als je verschillende fietsen wilt meenemen. Omdat het een achterklepdrager is, kan de kofferbaktoegang tijdens montage en vervoer beperkt worden en bij sommige auto’s kunnen zichtlijnen of verlichting door het pakket worden belemmerd — dat vergt controle en eventueel extra maatregelen om aan wetgeving te voldoen.
Tot slot: hoewel de ZipStrip-houders framebescherming bieden, is het bij gevoelige of zeer lichte framelakken nog steeds opletten geblazen; lange ritten over ruw wegdek kunnen vibraties veroorzaken die extra controle en mogelijke nabehandeling vragen. Voor gebruikers die maximale flexibiliteit, hogere capaciteit of permanente montage willen, zijn dak- of trekhaaksystemen vaak geschikter.