Hoewel de Yakima FullBack 3 veel sterke punten heeft, zijn er duidelijke beperkingen en aandachtspunten. Het meest beperkende is het gewichtslimiet: 13,6 kg per fiets en 40,8 kg totaal sluit vrijwel alle moderne e-bikes en veel zwaardere elektrische stadsfietsen uit. Als je regelmatig met e-bikes of bakfietsen reist, is deze drager niet geschikt. Een alternatief met trekhaak of speciaal e-bike-geschikte drager is dan noodzakelijk.
Een ander belangrijk nadeel is het feit dat de achterklep van de Volvo EX30 niet geopend kan worden zolang de drager gemonteerd is. Dat is niet alleen onhandig bij laden en lossen van bagage, maar kan ook problemen opleveren bij pech of als je snel iets uit de kofferbak moet pakken. Daarnaast kan de drager zicht op achterlichten, kentekenplaat of achteruitrijcamera belemmeren; dit kan juridische consequenties hebben afhankelijk van lokale regelgeving en zorgt voor extra aandacht bij het positioneren van verlichting of een extra kentekenplaatdrager.
Ten slotte vergt transport van fietsen die niet over een horizontale bovenbuis beschikken—zoals veel moderne step-through frames—een extra investering in de TubeTop-adapter. Terwijl die adapter goed werkt, betekent het wel extra kosten en extra handelingen bij het wisselen van fietsen. Ook al zijn rubberen kussens aanwezig, bij intensief gebruik en onzorgvuldige bevestiging blijft er risico op lakschade en slijtage van bevestigingspunten.